Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLVAPQ9BX97 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms