Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms