Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms