Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms