Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP9Q99956 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP9Q99956 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP9Q99956 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP9Q99956 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP9Q99956 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP9Q99956 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP9Q99956 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP9Q99956 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP9Q99956 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP9Q99956 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP9Q99956 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP9Q99956 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP9Q99956 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP9Q99956 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP9Q99956 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP9Q99956 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP9Q99956 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP9Q99956 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP9Q99956 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP9Q99956 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP9Q99956 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP9Q99956 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP9Q99956 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP9Q99956 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP9Q99956 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP9Q99956 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP9Q99956 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP9Q99956 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP9Q99956 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP9Q99956 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP9Q99956 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP9Q99956 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP9Q99956 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP9Q99956 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP9Q99956 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP9Q99956 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP9Q99956 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms