Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms