Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM3Q96MX0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM3Q96MX0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM3Q96MX0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM3Q96MX0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM3Q96MX0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM3Q96MX0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM3Q96MX0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM3Q96MX0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM3Q96MX0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM3Q96MX0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM3Q96MX0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM3Q96MX0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM3Q96MX0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM3Q96MX0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM3Q96MX0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM3Q96MX0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM3Q96MX0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM3Q96MX0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM3Q96MX0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM3Q96MX0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM3Q96MX0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM3Q96MX0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM3Q96MX0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM3Q96MX0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM3Q96MX0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM3Q96MX0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM3Q96MX0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM3Q96MX0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM3Q96MX0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM3Q96MX0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms