Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms