Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms