Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms