Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms