Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms