Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms