Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPNQ96H22 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms