Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms