Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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FAM3DQ96BQ1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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