Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms