Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms