Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms