Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms