Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC7Q8WUI4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC7Q8WUI4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms