Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms