Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ7

GNPDA2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA2Q8TDQ7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA2Q8TDQ7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms