Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BEST2Q8NFU1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BEST2Q8NFU1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
BEST2Q8NFU1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms