Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms