Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms