Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG8Q8ND04 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms