Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms