Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC89Q8N998 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms