Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTL3Q8N8U3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms