Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC24Q8N4L8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC24Q8N4L8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC24Q8N4L8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC24Q8N4L8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC24Q8N4L8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC24Q8N4L8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC24Q8N4L8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC24Q8N4L8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC24Q8N4L8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC24Q8N4L8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms