Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5D8

NANOGNB, NANOG neighbor homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGNBQ7Z5D8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NANOGNBQ7Z5D8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NANOGNBQ7Z5D8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NANOGNBQ7Z5D8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NANOGNBQ7Z5D8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NANOGNBQ7Z5D8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NANOGNBQ7Z5D8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NANOGNBQ7Z5D8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NANOGNBQ7Z5D8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NANOGNBQ7Z5D8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NANOGNBQ7Z5D8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms