Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms