Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms