Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms