Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L2Q6R6M4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms