Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPPQ6IPU0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPPQ6IPU0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPPQ6IPU0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPPQ6IPU0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPPQ6IPU0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPPQ6IPU0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPPQ6IPU0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPPQ6IPU0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPPQ6IPU0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPPQ6IPU0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPPQ6IPU0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPPQ6IPU0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPPQ6IPU0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPPQ6IPU0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPPQ6IPU0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPPQ6IPU0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPPQ6IPU0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPPQ6IPU0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPPQ6IPU0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPPQ6IPU0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPPQ6IPU0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPPQ6IPU0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPPQ6IPU0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPPQ6IPU0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPPQ6IPU0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPPQ6IPU0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPPQ6IPU0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPPQ6IPU0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPPQ6IPU0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPPQ6IPU0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPPQ6IPU0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPPQ6IPU0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPPQ6IPU0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPPQ6IPU0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPPQ6IPU0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPPQ6IPU0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPPQ6IPU0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPPQ6IPU0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms