Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CLQ60I27 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CLQ60I27 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CLQ60I27 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CLQ60I27 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CLQ60I27 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CLQ60I27 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CLQ60I27 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CLQ60I27 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CLQ60I27 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CLQ60I27 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CLQ60I27 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CLQ60I27 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CLQ60I27 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms