Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms