Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms