Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP78Q5JTW2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms