Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms