Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRDTQ58F21 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRDTQ58F21 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRDTQ58F21 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BRDTQ58F21 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRDTQ58F21 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRDTQ58F21 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRDTQ58F21 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRDTQ58F21 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRDTQ58F21 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRDTQ58F21 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRDTQ58F21 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRDTQ58F21 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRDTQ58F21 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRDTQ58F21 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRDTQ58F21 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRDTQ58F21 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRDTQ58F21 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRDTQ58F21 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRDTQ58F21 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRDTQ58F21 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRDTQ58F21 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRDTQ58F21 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRDTQ58F21 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BRDTQ58F21 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRDTQ58F21 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRDTQ58F21 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRDTQ58F21 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRDTQ58F21 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRDTQ58F21 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BRDTQ58F21 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRDTQ58F21 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRDTQ58F21 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRDTQ58F21 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms