Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms