Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms