Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms