Protein–RNA interactions for Protein: Q504Q3

PAN2, PAN2-PAN3 deadenylation complex catalytic subunit PAN2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN2Q504Q3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PAN2Q504Q3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PAN2Q504Q3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAN2Q504Q3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAN2Q504Q3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PAN2Q504Q3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAN2Q504Q3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAN2Q504Q3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAN2Q504Q3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAN2Q504Q3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms