Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00303Q3SY05 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00303Q3SY05 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00303Q3SY05 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00303Q3SY05 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00303Q3SY05 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms