Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NBPF8Q3BBV2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NBPF8Q3BBV2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF8Q3BBV2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF8Q3BBV2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF8Q3BBV2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF8Q3BBV2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF8Q3BBV2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF8Q3BBV2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF8Q3BBV2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF8Q3BBV2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF8Q3BBV2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF8Q3BBV2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF8Q3BBV2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF8Q3BBV2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF8Q3BBV2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF8Q3BBV2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF8Q3BBV2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF8Q3BBV2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF8Q3BBV2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF8Q3BBV2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF8Q3BBV2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NBPF8Q3BBV2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NBPF8Q3BBV2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NBPF8Q3BBV2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NBPF8Q3BBV2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NBPF8Q3BBV2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NBPF8Q3BBV2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NBPF8Q3BBV2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NBPF8Q3BBV2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NBPF8Q3BBV2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NBPF8Q3BBV2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NBPF8Q3BBV2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NBPF8Q3BBV2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NBPF8Q3BBV2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NBPF8Q3BBV2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NBPF8Q3BBV2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms