Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL38Q2WGJ6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL38Q2WGJ6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL38Q2WGJ6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms